Sequenciamento, notificação fungos filamentoso leveduras, cepa de microrganismo

Orientações para o cliente

• Este exame é realizado somente com resultado de cultura de fungos positiva em diversos materiais. - Em geral, o Fleury faz a análise em amostras de fungos ou leveduras isolados em outro laboratório, mas que não tenham sido identificados e necessitam de sequenciamento genético para identificação em nível de gênero e espécie. - É condição, para a realização do exame, que a amostra (cepa) esteja viável.

Processamento e adequação da amostra

Enviar o material junto para a Seção de Microbiologia em temperatura ambiente.

Método

Sequenciamento de DNA por método de Sanger

Interpretação e comentários

A incidência de infecções fúngicas invasivas vem aumentando em decorrência do aumento do número e da sobrevida de indivíduos imunossuprimidos. Além disso, espécies patogênicas emergentes têm se tornado mais comuns em nosso meio. Especialmente para fungos filamentosos, a identificação morfológica requer procedimentos demorados e de leitura visual, enquanto os métodos automatizados disponíveis não possuem boa acurácia para essa identificação. O sequenciamento genético permite identificação acurada e mais ágil em relação à metodologia tradicionalmente utilizada, além de possibilitar a diferenciação entre espécies, o que tem impacto na instituição precoce e direcionada da terapia antifúngica. O sequenciamento fúngico da região ITS do DNA é indicado para a identificação de fungos filamentosos e leveduras. A depender do gênero fúngico, para identificação em nível de espécie, pode ser necessária amplificação de outros alvos do DNA (D1-D2, beta-tubulina ou TEF1-alpha). A sequência obtida é comparada àquelas disponíveis no GenBank e no MycoBank, para maior exatidão na identificação.

Orientações necessárias

Este exame é realizado somente com resultado de cultura de fungos positiva em diversos materiais.

• Em geral, o Fleury faz a análise em amostras de fungos ou leveduras isolados em outro laboratório, mas que não tenham sido identificados e necessitam de sequenciamento genético para identificação em nível de gênero e espécie.
• É condição, para a realização do exame, que a amostra (cepa) esteja viável.

Valor de referência

Não aplicável.