SEQUENCIAMENTO DO GENOMA HUMANO, reanálise, Diversos

Orientações para o cliente

"I - Preparo

• Para realizar este exame, não é preciso coletar nova amostra.

Em tais situações, o teste compreende a análise de amostra do(a) cliente.

II - Exame

• É necessário envio do pedido médico e relatório clínico. Para esse exame será liberado um laudo em sistema.
• Menores de 18 anos devem estar acompanhados de um adulto responsável para a realização do exame.
• É necessário o preenchimento de questionário/formulário.

III - Resultado

• As variantes identificadas no teste de Genoma poderão ser selecionadas, de acordo com avaliação das assessorias médicas e técnicas, para estudo adicional com metodologia complementar Sanger. Esse estudo adicional tem como objetivo confirmar a presença e a segregação dessas variantes identificadas, utilizando uma análise em conjunto dos resultados das amostras do cliente e dos pais (quando disponíveis). Dessa forma, a complementação do laudo, com os resultados dessa confirmação por metodologia Sanger, será disponibilizado em até 25 dias corridos após a liberação dos resultados parciais do Genoma.
• Caso este exame apresente variante patogênica ou possivelmente patogênica, nós disponibilizamos o exame: AVALIAÇÃO DE ALTERAÇÕES GENÉTICAS, IDENTIFICADAS, FAMILIARES para até 06 familiares (sem ônus e sem taxa de envio de coleta).

Atenção: A liberação do benefício está sujeita à confirmação mediante análise do laudo pela equipe médica do Grupo Fleury.

ATENÇÃO: Caso o médico solicitante tenha dúvidas com relação ao resultado do exame, ofertamos de forma gratuita uma assessoria entre médicos (médico solicitante e médico Fleury).

Não realizamos discussão do caso entre Paciente e Médico Fleury, porém possuímos uma consulta de aconselhamento genético (com ônus) caso o paciente e familiar queiram informações adicionais sobre análise genética.

Para saber mais sobre este exame e como realizar, acesse www.fleurygenomica.com.br.

Telefone: 3003-5001

WhatsApp: (11) 3003-5001

E-mail: [email protected] "

Orientações necessárias

"I - Preparo

• Para realizar este exame, não é preciso coletar nova amostra.

Em tais situações, o teste compreende a análise de amostra do(a) cliente.

II - Exame

• É necessário envio do pedido médico e relatório clínico. Para esse exame será liberado um laudo em sistema.
• Menores de 18 anos devem estar acompanhados de um adulto responsável para a realização do exame.
• É necessário o preenchimento de questionário/formulário.

III - Resultado

• As variantes identificadas no teste de Genoma poderão ser selecionadas, de acordo com avaliação das assessorias médicas e técnicas, para estudo adicional com metodologia complementar Sanger. Esse estudo adicional tem como objetivo confirmar a presença e a segregação dessas variantes identificadas, utilizando uma análise em conjunto dos resultados das amostras do cliente e dos pais (quando disponíveis). Dessa forma, a complementação do laudo, com os resultados dessa confirmação por metodologia Sanger, será disponibilizado em até 25 dias corridos após a liberação dos resultados parciais do Genoma.
• Caso este exame apresente variante patogênica ou possivelmente patogênica, nós disponibilizamos o exame: AVALIAÇÃO DE ALTERAÇÕES GENÉTICAS, IDENTIFICADAS, FAMILIARES para até 06 familiares (sem ônus e sem taxa de envio de coleta).

Atenção: A liberação do benefício está sujeita à confirmação mediante análise do laudo pela equipe médica do Grupo Fleury.

ATENÇÃO: Caso o médico solicitante tenha dúvidas com relação ao resultado do exame, ofertamos de forma gratuita uma assessoria entre médicos (médico solicitante e médico Fleury).

Não realizamos discussão do caso entre Paciente e Médico Fleury, porém possuímos uma consulta de aconselhamento genético (com ônus) caso o paciente e familiar queiram informações adicionais sobre análise genética.

Para saber mais sobre este exame e como realizar, acesse www.fleurygenomica.com.br.

Telefone: 3003-5001

WhatsApp: (11) 3003-5001

E-mail: [email protected]

Processamento e adequação da amostra

" Não é necessário envio de nova amostra coletada pelo cliente. A Reanalise é realizada a partir dos dados brutos gerados em processamento de amostra prévia do cliente. A sigla HDWGS30REANALIS poderá ser aberta para clientes que já realizaram exame da sigla HDWGS30 em Genesis ou que realizaram exame de Genoma Completo no Hospital Albert Einstein. Para outras situações consultar núcleo genômica ou setor técnico AC-Genomica (Genesis). Para dúvidas sobre o tipo de painel realizado pelo cliente, entrar em contato via e-mail [email protected] e Núcleo de Genomica (manifestação).

Abrir a ficha com a sigla HDWGS30REANALIS.

Gerar manifestação de inclusão e direcionar para a fila Sede Brooklin – Inclusões e Antecipações Marcas ou Sede Brooklin – Inclusões e Antecipações Fleury, mencionando o número de ficha anterior e ficha da inclusão.

Importante: Não é necessário realizar a leitura da etiqueta nos setores de Enfermagem e Distribuição."

Método

Os dados são processados para detecção de variantes pontuais, alterações de número de cópias e variantes estruturais conforme melhores práticas para pipeline de bioinformática. Os parâmetros de qualidade para análise são cobertura média mínima acima de 20x das bases e no mínimo 90% de profundidade acima de 10x. A classificação da variante é feita através do transcrito de referência a partir da base A do códon de inicialização ATG alinhado contra o genoma referência GRCh38/hg38 e NC_012920.1 (mitocondrial). As variantes descritas no laudo são anotadas seguindo as recomendações descritas pela Human GenomeVariation Society (HGVS) e, para variantes mitocondriais, Revised Cambridge Reference Sequence ("rCRS"). As variantes são interpretadas considerando o quadro clínico do paciente e o protocolo de classificação de variantes do Colégio Americano de Genética Médica (ACMG).

Interpretação e comentários

"O sequenciamento completo do genoma humano é solicitado quando o histórico médico e exame físico do paciente indicam fortemente uma etiologia genética. Na maioria dos casos, o paciente já passou por diversos testes, mas uma etiologia não foi identificada.

O sequenciamento completo do genoma humano é um exame de alta complexidade que foi desenvolvido para identificar alterações no DNA do paciente que podem estar relacionadas ou serem causadoras de problemas médicos. Ao invés de investigar genes individuais ou pequenos grupos de genes, todas as regiões codificadoras e não codificadoras do genoma são analisadas simultaneamente utilizando-se a tecnologia de sequenciamento massivo paralelo. O exame também contempla a análise completa do genoma mitocondrial.

Sabe-se que a maioria dos erros que ocorrem nas sequencias de DNA que levam a doenças genéticas estão localizados nos exons e algumas regiões não codificantes dos genes, portanto, o sequenciamento completo do genoma é um método bastante eficiente para a descoberta da causa de doenças ou anomalias. O teste é baseado no sequenciamento de cada nucleotídeo do genoma humano de um indivíduo, com cobertura média de 20-30X. Esta sequência é então comparada a padrões e referências (GRCh38) do que é considerado normal na população. A análise dos dados é realizada a partir dos dados gerados com auxílio de softwares especializados juntamente com bancos de dados curados e literatura científica especializada, interpretados por uma equipe médica multidisciplinar buscando a melhor interpretação molecular e médica. O sequenciamento completo do genoma humano é uma técnica altamente sensível, capaz de identificar muitas variantes genéticas com potencial impacto clínico. No entanto, como qualquer exame laboratorial, ele possui limitações. Devido à complexidade intrínseca de tais variantes associada a eventuais limitações da metodologia, não é possível assegurar para todos os eventos a exatidão dos limites reportados. Variantes podem não ser relatadas caso estejam presentes em regiões gênicas não sequenciadas adequadamente, regiões ricas em repetições e áreas com pseudogene. Devido às limitações técnicas não é indicado para investigar doenças genéticas causadas por expansões de trechos repetidos do DNA, bem como a análise do número de cópias do gene SMN1."